подскажите что не так ?

// Пишем цикл по его заполнению
 for (int i = 0; i < N /* можно и как у Вас указать через размер массива*/; i++){
     arrey[i] = Integer.parseInt(reader.readLine()); // как и у Вас считываем числа и заполняем одновременно массив
 }

 int maximum = arrey[0];  //инициализация первым элементом

 // Заполнили далее пишем цикл на сравнение элементов массива
 for (int i = 1; i < arrey.length; i++) {
     if (maximum < arrey[i]) maximum = arrey[i]; //убираем проверку на первый элемент, цикл выполнит меньшее кол-во команд
 }

for (int i = 0; i < N; i++){
            int l = Integer.parseInt(reader.readLine());

            if (h == true){
                if(maximum < l) maximum = l;
            }
            else {
                maximum = l;
                h = true;
            }
        }

...
int N = Integer.parseInt(reader.readLine());
int maximum = Integer.parseInt(reader.readLine());

for (int i = 0; i < N-1; i++){
    int l = Integer.parseInt(reader.readLine());
    if(maximum < l) maximum = l;
}
...

int maximum = Integer.MIN_VALUE;