Можно ли скрыть переменные и их значения?

Это надо через import java.util.Scanner использовать?

Можно как и через Scanner так и через BufferedReader Вот ниже как создаются обьекты их.

BufferedReader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));

Scanner sc = Scanner(System.in);

Это два ридера можешь использовать один их них. Если будешь использовать Scanner.

int x = sc.nextInt();

Если будешь использовать BufferedReader То пиши

int x = Integer.parseInt(reader.readLine());

Если помог поставь возле меня кнопку решение.

Допустим, я объявил переменную num типа int, и мне надо сделать так, чтобы в самом коде не было видно значение этой самой num.

а зачем это делать? ведь только ты решаешь, где какие переменные будут видны. без примера не очень понятно почитай про область видимости данных. а вообще для скрытия данных класса и существует Инкапсуляция, советую и про неё почитать.

Я новичок и знаю только объявления переменных и System.out.println(); Как думаете, мне ещё рано учиться инкапсуляции или надо подтягивать основы?

не рано совсем. там ничего сложного нет для общего понимания. если новичок, решай задачи последовательно, как они даются на курсе. со временем появится понимание что и как. а если что-то непонятно, спрашивай.