hasNextInt и другие hasNext'ы переводят курсор на следующую строку

hasNext-ы никакие вообще ничего не переводят, они только проверяют, есть ли что-то дальше, не переходя к этому следующему элементу. Переходят просто next-ы. Если при этом чередовать использование nextLine после nextInt и любых других nextSomething, то nextLine Будет считывать пустую строку, оставшуюся после считывания числа/boolean/чего-то еще. Чтобы не запутаться, лучше так не делать и считывать все только nextLine() и потом их уже парсить в числа. Возможно у тебя просто два оператора next в одном цикле, и за каждую итерацию производишь два считывания. В общем, гадать можно долго, покажи код.

Scanner console = new Scanner(System.in);

        boolean ch = false;

        int sum = 0;
        int x = 0;

        String en = "ENTER";
        String str="";

        while (!ch){
            x = console.nextInt();
            sum = sum + x;
            if( !console.hasNextInt())
            {   str = console.nextLine();
                ch = str.equals(en);
                System.out.println(sum);
                break;  }
        }