Ребята, решил задачу через StringBuilder. программа работает согласно условию, но решение по 2 пункту не принимает почему-то. Есть мысли? Код в блоке try 
try (Scanner scanner = new Scanner(System.in))
         {
            List<String> list = Files.readAllLines(Paths.get(scanner.nextLine()));
            StringBuilder str = new StringBuilder(list.toString());

            for(int i = 0; i < str.length(); i++)
                if(str.charAt(i) == '.'){
                    str.deleteCharAt(i);
                    i--;}
                else {
                    if (str.charAt(i) == ','){
                        str.deleteCharAt(i);
                    i--;}
                    else {
                        if (str.charAt(i) == ' '){
                            str.deleteCharAt(i);
                            i--;}
                    }
                }
             System.out.println(str);
        }