Прошу совет.

for (int i = 0; i < arrayA.length; i++) {
            arrayA[i] = Integer.parseInt(reader.readLine());
}

        int temp = 0;
        for(int i = 0; i < arrayA.length; i++) {

            if (i < 10 ) {
                arrayB[i] = arrayA[i];
            } else {
                arrayC[temp] = arrayA[i];
                System.out.println(arrayC[temp]);
                temp++;
            }
        }

Ну вот я переделал твой код за 10 минут. Но он всё равно очень хардкорден. Оставлен один внешний счетчик, но убраны внутренние форы, я не очень понял зачем они были нужны. Ну и не проверил конечно. Вообще процесс мышления у людей слегка всегда различается и нельзя сказать что у тебя плохой код. Но можно сказать что плохо читаем. Значит "грязный".

Что-то похожее можно сделать:

for(int i = 0; i < arrayA.length; i++) {

            if (i < 10) {
                    arrayB[i] = arrayA[i];
            } else {

                    arrayC[i - 10] = arrayA[i];
            }
}