при добавлении аргументов в настройках IDE, и запуск программы средствами IDE, программа отрабатывает нормально, но когда запускаю плагином пишет что массив пуст

А я сам не понял - в условии написано - "полученную из аргумента метода main(String[])" Для менЯ это не понятно. Я сделал то что сказано - заменил метод который работает с символами на метод который работает с байтами. Вот и все что требуется.